Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CCL3L1P16619 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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