Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms