Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms