Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms