Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN11O75508 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms