Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms