Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA2O43364 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms