Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC3O15379 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms