Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCAO15360 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FANCAO15360 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCAO15360 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCAO15360 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms