Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VILLO15195 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VILLO15195 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VILLO15195 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms