Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN8O00124 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms