Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms