Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E9PBE3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E9PBE3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms