Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf172C9J069 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf172C9J069 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf172C9J069 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf172C9J069 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C9orf172C9J069 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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