Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms