Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms