Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms