Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms