Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POMPQ9Y244 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms