Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms