Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms