Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSFQ9UBX1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms