Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms