Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms