Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC180Q9P1Z9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms