Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP4Q9P0V3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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