Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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