Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms