Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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