Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms