Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIPCQ9C0C6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms