Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM4Q9C037 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM4Q9C037 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM4Q9C037 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM4Q9C037 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM4Q9C037 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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