Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5DQ9BY66 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms