Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A2Q9BY10 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms