Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms