Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms