Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms