Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM43Q9BTV4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms