Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAGR1Q9BTK6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms