Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms