Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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