Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RNF185Q96GF1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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