Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms