Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms