Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms