Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms