Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPTSSAQ969W0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPTSSAQ969W0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPTSSAQ969W0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPTSSAQ969W0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTSSAQ969W0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPTSSAQ969W0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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