Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEO1Q92859 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEO1Q92859 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms