Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WDR53Q7Z5U6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WDR53Q7Z5U6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms