Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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